Designada primitivamente por São Domingos da Fanga da Fé, com sede na, então, paroquial de São Domingos, situada onde existe actualmente a Capela com o mesmo orago. A qual, tendo ficado muito arruinada pelo terramoto de 1 de Novembro de 1755, foi substituída, na sua função, pela Ermida de Nossa Senhora da Encarnação da Lobagueira (actual Encarnação), onde se manteve até à actualidade.
A data da sua fundação é, ainda, desconhecida. No entanto, já aparece referenciada a sua existência no longínquo ano de 1542, como paróquia filial da matriz de São Tiago de Torres Vedras, que apresentava o seu pároco, como Cura anual.
Monumento de interesse nacional desde 1945, o seu orago é Nossa Senhora da Encarnação e a sua fundação, propiciada pelo Morgado da Lobagueira, proprietário do terreno e pelo povo, remonta ao ano de 1604, ainda como Ermida com o mesmo orago. Santuário de grande nomeada, logo desde os primórdios a ela acorriam círios originários das mais diversas localidades da região situada entre Lisboa e a Lourinhã. Após o terramoto de 1 de Novembro de 1755, após a ruína que sofreu a antiga Matriz de S. Domingos, foi cedida orologi replica pelos seus propietários, os Condes de Belmonte, para servir como Igreja Paroquial.
Com o orago de São Francisco de Assis. Foi fundada para dar resposta às necessidades de âmbito religioso que sentiam os habitantes das povoações das Quintas, Galiza, Talefe e Valongo.
Após a compra do terreno, foi lançada a primeira pedra em 1987 e iniciaram-se os trabalhos, com o grande empenho e participação de toda a população, tendo por base os fundos orologi repliche angariados nos diversos convívios da matança do porco realizados para o efeito. Foi inaugurada em 1993, por D. António Ribeiro, Cardeal Patriarca de Lisboa.
Antiga ermida com o orago de Santa Susana, que perdurou até ao século XIX, quando passou ao actual, levando, também, à mudança do topónimo da localidade onde está inserida.replicas de relojes
Desconhece-se a data da sua fundação. Mas, há documentação histórica que referencia a sua existência em 1625.